Les contre-indications strictes concernent les situations où la pratique de la sonothérapie est déconseillée ou doit être suspendue, car elle peut présenter un risque réel pour la personne, notamment en présence de dispositifs médicaux implantés actifs, de pathologies neurologiques instables ou de troubles psychiatriques sévères non stabilisés. D’autres situations relèvent de simples précautions, à condition d’adapter les sons, l’intensité et la durée.